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Título : Vigilância molecular e metagenômica dos casos de síndrome gripal no Distrito Federal, Brasil
Autor : Quintão, Tatyane de Souza Cardoso
Orientador(es):: Haddad, Rodrigo
Coorientador(es):: Pereira, Alex Leite
Assunto:: Vigilância molecular
Vírus respiratórios
Vigilância metagenômica
SARS-CoV-2
Fecha de publicación : 5-dic-2024
Citación : QUINTÃO, Tatyane de Souza Cardoso. Vigilância molecular e metagenômica dos casos de síndrome gripal no Distrito Federal, Brasil. 2024. 70f. Tese (Doutorado em Medicina Tropical) — Universidade de Brasília, Brasília, 2024.
Resumen : Síndrome gripal (SG) é caracterizada por uma infecção respiratória aguda que frequentemente pode estar associada à presença de vírus respiratórios, principalmente, coronavírus, adenovírus, rinovírus e vírus sincicial respiratório. Em 2019, emergiu em Wuhan um novo coronavírus denominado coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARSCoV-2). Com o nome oficial de covid-19, a infecção pelo SARS-CoV-2 rapidamente alcançou escala global se tornando uma pandemia e representando uma ameaça à saúde pública. Considerando que os sintomas das infecções por vírus respiratórios são muito semelhantes, este estudo tem por objetivo realizar a vigilância molecular e metagenômica de SARS-CoV-2 e outros vírus respiratórios, em amostras de pacientes atendidos na Unidade Básica de Saúde da Cidade Estrutural (DF). No período de março/2021 a março/2022, foram analisadas 2.695 amostras, sendo 832 (31%) casos positivos e 1.863 (69%) casos negativos para SARS-CoV-2. A metagenômica realizada em 320 amostras negativas para SARS-CoV-2, possibilitou a identificação de adenovírus, rinovírus, coronavírus 229E, coronavírus NL63 e surpreendentemente, vírus Chikungunya. A genotipagem das amostras positivas para SARS-CoV-2, através de RT-qPCR, possibilitou a identificação das principais variantes associadas aos picos de casos na Cidade Estrutural, além disso, através do sequenciamento de 76 amostras foi possível constatar 100% de concordância entre as técnicas. A vigilância de síndrome gripal possibilita identificar os principais vírus respiratórios em circulação, o que é fundamental para auxiliar no planejamento e adequação de medidas de prevenção e controle de infecções.
Abstract: Flu syndrome (FS) refers to an acute respiratory infection caused by the presence of respiratory viruses, including coronaviruses, adenoviruses, rhinoviruses, and respiratory syncytial viruses. At the end of 2019, a novel coronavirus emerged in Wuhan, known as SARS-CoV-2. Named covid-19, SARS-CoV-2 infection quickly spread globally, causing a pandemic and threatening public health. This study aimed to monitor SARS-CoV-2 and other respiratory viruses in samples from patients at the Cidade Estrutural Basic Health Unit (DF) by conducting molecular and metagenomic surveillance. Between March 2021 and March 2022, 2,695 samples were analyzed, with 832 (31%) testing positive for SARS-CoV-2 and 1,863 (69%) testing negative. Metagenomics of 320 negative samples revealed the presence of adenoviruses, rhinoviruses, coronavirus 229E, coronavirus NL63, and the Chikungunya virus. RT-qPCR genotyping of positive SARS-CoV-2 samples identified the main variants associated with peaks in the Cidade Estrutural, and sequencing confirmed the results. Monitoring flu syndrome is crucial for identifying the predominant respiratory viruses and implementing effective measures for preventing and controlling infections.
metadata.dc.description.unidade: Faculdade de Medicina (FM)
Descripción : Tese (doutorado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical, 2024.
metadata.dc.description.ppg: Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical
Licença:: A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data.
Agência financiadora: Fundação de Apoio à Pesquisa do Distrito Federal (FAPDF).
Aparece en las colecciones: Teses, dissertações e produtos pós-doutorado

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