Vigilância molecular e metagenômica dos casos de síndrome gripal no Distrito Federal, Brasil

Abstract

Síndrome gripal (SG) é caracterizada por uma infecção respiratória aguda que frequentemente pode estar associada à presença de vírus respiratórios, principalmente, coronavírus, adenovírus, rinovírus e vírus sincicial respiratório. Em 2019, emergiu em Wuhan um novo coronavírus denominado coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARSCoV-2). Com o nome oficial de covid-19, a infecção pelo SARS-CoV-2 rapidamente alcançou escala global se tornando uma pandemia e representando uma ameaça à saúde pública. Considerando que os sintomas das infecções por vírus respiratórios são muito semelhantes, este estudo tem por objetivo realizar a vigilância molecular e metagenômica de SARS-CoV-2 e outros vírus respiratórios, em amostras de pacientes atendidos na Unidade Básica de Saúde da Cidade Estrutural (DF). No período de março/2021 a março/2022, foram analisadas 2.695 amostras, sendo 832 (31%) casos positivos e 1.863 (69%) casos negativos para SARS-CoV-2. A metagenômica realizada em 320 amostras negativas para SARS-CoV-2, possibilitou a identificação de adenovírus, rinovírus, coronavírus 229E, coronavírus NL63 e surpreendentemente, vírus Chikungunya. A genotipagem das amostras positivas para SARS-CoV-2, através de RT-qPCR, possibilitou a identificação das principais variantes associadas aos picos de casos na Cidade Estrutural, além disso, através do sequenciamento de 76 amostras foi possível constatar 100% de concordância entre as técnicas. A vigilância de síndrome gripal possibilita identificar os principais vírus respiratórios em circulação, o que é fundamental para auxiliar no planejamento e adequação de medidas de prevenção e controle de infecções.