Campo DC | Valor | Idioma |
dc.contributor.advisor | Barbosa, João Alexandre Ribeiro Gonçalves | pt_BR |
dc.contributor.author | Neves, Daniel Vieira | pt_BR |
dc.date.accessioned | 2025-01-16T20:26:32Z | - |
dc.date.available | 2025-01-16T20:26:32Z | - |
dc.date.issued | 2025-01-16 | - |
dc.date.submitted | 2024-08-21 | - |
dc.identifier.citation | NEVES, Daniel Vieira. Caracterização da enzima 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintase para desenvolvimento de biossensor para detecção de glifosato. 2024. 96 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular) — Universidade de Brasília, Brasília, 2024. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio.unb.br/handle/10482/51397 | - |
dc.description | Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2024. | pt_BR |
dc.description.abstract | A 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintase (EPSPS, EC 2.5.1.19) é a enzima que catalisa
a sexta etapa da via do shikimato, cujo produto final, corismato, é precursor da biossíntese
dos aminoácidos aromáticos e, por consequência, da produção de diversos metabólitos
secundários necessários às plantas e microrganismos. O glifosato, inibidor da EPSPS, é
atualmente o herbicida mais utilizado no Brasil, o que causa um acúmulo deste
agroquímico em corpos de água. Embora não haja consenso pelas agências reguladoras,
o glifosato é classificado como provável carcinógeno humano pela Agência Internacional
para Pesquisa sobre Câncer, além de existirem outros estudos que o sugerem como agente
causador de outras comorbidades humanas. Assim, este trabalho se propõe a caracterizar
a EPSPS de Escherichia coli (Ec-EPSPS) para desenvolvimento de um biossensor por
ressonância plasmônica de superfície (SPR), visando a detecção do glifosato presente na
água. O gene da Ec-EPSPS foi clonado em vetores pET-M11 e pET-SUMO, que foram
inseridos em bactérias E. coli BL21 (DE3) e Rosetta por transformação de choque
térmico. Foram realizados testes de expressão da Ec-EPSPS em meio LB e ZYM-5052.
O clone BL21 (DE3) transformado com pET-M11 expressou a proteína solúvel em meio
ZYM-5052. A purificação da proteína foi realizada em duas etapas: cromatografia de
afinidade a metal imobilizado, e cromatografia de exclusão molecular. Dados de
dicroísmo circular apontam que a Ec-EPSPS mantém seu conteúdo de estruturas
secundárias entre os pH 4,0 e 9,0, e é termoestável entre 10 ºC e 50 ºC em pH 7,5. Ensaios
de atividade mostram que a Ec-EPSPS obtida neste estudo está ativa, apresentando Km
para shikimato-3-fosfato e fosfoenolpiruvato em 0,055 ± 0,018 mM e 0,148 ± 0,023 mM,
respectivamente. A Ec-EPSPS é classificada como classe I entre as EPSPS, ou seja, é
inibida em concentrações micromolares de glifosato. Isso foi demonstrado por ensaio de
inibição, onde o IC50 foi determinado em 0,016 ± 0,006 mM. Todos os dados aqui
apresentados quanto à afinidade da Ec-EPSPS por seus substratos e inibidor estão de
acordo com os encontrados na literatura. Em relação às análises por SPR, foi observado
um deslocamento de 0,75° entre os pontos mínimos das curvas de ressonância, que
representam o sistema antes e depois da aplicação de Ec-EPSPS. Esse deslocamento pode
estar relacionado à imobilização da proteína à superfície dos chips, através da sua cauda
de histidina. Porém, o sistema empregado até então não é capaz de verificar a presença
de glifosato em solução, mesmo em concentrações altas. Outros trabalhos publicados na
literatura, que utilizaram equipamentos já estabelecidos no mercado, obtiveram
resultados mais satisfatórios quanto ao uso de SPR para detecção de glifosato. Os
resultados destes são discutidos neste trabalho, a fim de ressaltar o potencial da técnica
de SPR para análises ambientais. | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Caracterização da enzima 5-enolpiruvilshikimato-3-fosfato sintase para desenvolvimento de biossensor para detecção de glifosato | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.subject.keyword | Escherichia coli | pt_BR |
dc.subject.keyword | Ressonância plasmônica de superfície | pt_BR |
dc.subject.keyword | Biossensores | pt_BR |
dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
dc.description.abstract1 | The 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS, EC 2.5.1.19) is the enzyme
that catalyzes the sixth step of the shikimate pathway, whose final product, chorismate,
is a precursor to the biosynthesis of aromatic amino acids and, consequently, to the
production of several secondary metabolites necessary for plants and microorganisms.
Glyphosate, an EPSPS inhibitor, is currently the most widely used herbicide in Brazil,
leading to an accumulation of this agrochemical in water sources. Although there is no
consensus among regulatory agencies, glyphosate is classified as a probable human
carcinogen by the International Agency for Research on Cancer, in addition to other
studies suggesting its involvement in other human comorbidities. Thus, this work aims to
characterize the EPSPS of Escherichia coli (Ec-EPSPS) for the development of a
biosensor by surface plasmon resonance (SPR), targeting the detection of glyphosate
present in water. The gene of Ec-EPSPS was cloned into pET-M11 and pET-SUMO
vectors, which were inserted into E. coli BL21 (DE3) and Rosetta bacteria through
thermal shock transformation. Expression tests of Ec-EPSPS were conducted in LB and
ZYM-5052 media. The BL21 (DE3) clone transformed with pET-M11 expressed the
soluble protein in ZYM-5052 medium. The protein purification was carried out in two
steps: immobilized metal affinity chromatography and size exclusion chromatography.
Circular dichroism data indicate that Ec-EPSPS maintains its content of secondary
structures between pH 4.0 and 9.0, and it is thermostable between 10 °C and 50 °C, at pH
7.5. Activity assays show that the Ec-EPSPS obtained in this study is active, presenting
Km values for shikimate-3-phosphate and phosphoenolpyruvate of 0.055 ± 0.018 mM and
0.148 ± 0.023 mM, respectively. Ec-EPSPS is classified as class I among EPSPS
enzymes, meaning it is inhibited at micromolar concentrations of glyphosate. This was
demonstrated by inhibition assay, where the IC50 was 0.016 ± 0.006 mM. All data
presented here regarding the affinity of Ec-EPSPS for its substrates and inhibitor are in
accordance with those found in the literature. Regarding the SPR analyses, a displacement
of 0.75° was observed between the minimum points of the resonance curves, which
represent the system before and after the application of Ec-EPSPS. This displacement
may be related to the immobilization of the protein on the chip surface, through its histag. However, the system used so far is not capable of detecting the presence of glyphosate
in solution, even at high concentrations. Other works published in the literature, which
utilized equipments already established in the market, achieved more satisfactory results
regarding the use of SPR for glyphosate detection. The results of these studies are
discussed in this work in order to highlight the potential use of the SPR technique for
environmental analysis. | pt_BR |
dc.description.unidade | Instituto de Ciências Biológicas (IB) | pt_BR |
dc.description.unidade | Departamento de Biologia Celular (IB CEL) | pt_BR |
dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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