Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2

Abstract

O vírus SARS-CoV-2 é o agente etiológico responsável da COVID-19 e que produziu a pandemia global que tomou conta do mundo em 2020. Para SARS-CoV-2, a proteína spike na superfície do vírus é o alvo principal da maioria das vacinas atuais. A proteína spike é responsável pela capacidade do vírus de entrar nas células humanas e, portanto, é um componente crucial do mecanismo infeccioso do vírus. Ao provocar uma resposta imune contra epítopos específicos na proteína spike, as vacinas visam impedir que o vírus infecte as células e se espalhe pelo corpo. Compreender os epítopos específicos visados pelas vacinas é fundamental para desenvolver e melhorar as vacinas e para entender por que algumas variantes do SARS-CoV-2 podem ser menos suscetíveis às vacinas atuais. Dentro deste contexto o desenvolvimento de anticorpos monoclonais para o COVID-19 e foi elaborado o projeto “Caracterização e classificação de epítopos de anticorpos monoclonais selecionados por Phage Display com potencial neutralizante anti-SARS-CoV-2” dentro do macroprojeto “Anticorpos na terapia da COVID-19: estudo clínico de fase IIa, com plasma de convalescentes e geração de anticorpos monoclonais humanos”, em colaboração com a Fundação Hemocentro, o Hospital Universitário de Brasília (HUB) e o Hospital Regional da Asa Norte (HRAN). Nele, anticorpos foram selecionados pelo método de Phage Display a partir de RNA extraído de plasma de pacientes convalescentes. Foram produzidos e purificados anticorpos no formato scFv, e após análise de resultados foram selecionados 6 anticorpos distintos com sequências únicas, e caracterizados como classe 1 e clonótipos 2. Estes também são conhecidos como clonótipos públicos IGHV3-53/3-66 com características de neutralização específicas, seligando a múltiplos locais vulneráveis do vírus na sua região RBD. Assim, os achados obtidos viabilizaram destacar a importância das mutações somáticas na capacidade de ligação e neutralização dos anticorpos. Este dado foi confirmado com a identificação dos epítopos destes anticorpos, processo que permitiu conhecer o local de ligação no RBD, especificamente em sua região RBS, e hipotetizar a possível forma de ligação dos mesmos a partir de estudos de alinhamento de sequências das regiões determinantes de complementaridade (CDRs) com anticorpos com alta percentagem de identidade e com estruturas descritas. A partir do conseguido aqui, os próximos passos implicaram continuar desenvolvendo uma estratégia combinatória que envolva a especificidade e funcionalidade dos anticorpos, e a geração de anticorpos específicos contra o SARS-CoV-2 no formato IGG1.