Diversidade e identificação de fungos fitopatogênicos em frutos não convencionais no Brasil

Abstract

Frutos não convencionais à agricultara brasileira, como Syzygium jambos (Myrtaceae) apesar de possuir significante importância na medicina tradicional, possuem um número raro de estudos focados em doenças que podem afetar esta espécie. Gêneros de fungos das famílias Nectriaceae, Bionectriaceae e Botryosphaeriaceae são frequentemente encontrados como fitopatógenos de plantas, relatados como associados a doenças de importância agrícola e florestal mas raramente associados a plantas nativas ou ao sintomas de podridão de frutos. A identificação desses fungos é desafiadora, especialmente o grupo Calonectria-like (Nectriaceae) por englobar fungos relacionados filogeneticamente e morfologicamente ao gênero Calonectria. Com isso técnicas moleculares foram implementadas para o grupo a partir de 1995 com a submissão sequências depositadas no Genbank, que se tornou um valoroso recurso para os pesquisadores deste grupo. O crescente volume de dados na plataforma dificulta ou impossibilita estudos de diversidade de hospedeiros, localidade e dispersão geográfica, devido à falta de uniformidade dos dados depositados. O presente estudo teve como objetivo fazer uma meta-análise do banco de dados para gêneros de Calonectria-like, além de identificar por análises morfofilogeneticamente os isolados de Calonectria-like, Clonostachys e Neofusicoccum obtidos a partir de frutos nos estados de Distrito Federal, Goiás, Minas Gerais, Paraná, Pernambuco, Santa Catarina e São Paulo. Com a meta-análise revelou disparidades na amostragem de regiões genéticas, com os genes tef (n=5.125) e tub (n=5.287) os mais frequentemente depositados. Observando o “Efeito Matryoshka” por haver uma superrepresentação de isolados, devido a transferência entre laboratórios. Os metadados revelaram uma perda de 21.7% de dados de localidade, 88% para substrato/hospedeiros. No entanto os metadados permitiram identificar que o isolamento geográfico dos gêneros Xenocylindrocladium (América do Sul) e Curvicladiella (Ásia), além de Brasil (n=64) e China (n=51) apresentarem maior diversidade de espécies destes gêneros. Foram obtidos 86 isolados, os quais foram submetidos a análises morfo-filogenéticas, segregando dentro dos gêneros Calonectria (n=15), Clonostachys (n=8), Cylindrocladiella (n=28), Gliocladiopsis (n=18), Gliocephalotrichum (n=2) e Neofusicoccum (n=15). Desse total, sete espécies conhecidas foram documentadas enquanto seis táxons serão propostos como novas espécies. As espécies Cylindrocladiella vitis, Gliocladiopsis hennebertii e Neofusicoccum occulatum e N. umdonicola são relatadas pela primeira vez no Brasil. Enquanto novas combinações de hospedeiros foram registradas para Ch. Pseudocholeuca, Ch. rogersoniana, Cy. infestans, Cy. lageniformis, Cy. peruviana, Gliocephalotrichum simplex, Gliocladiopsis tenuis, N. batangarum, e N. parvum em frutos de Dypsis madagascariensis, Eugenia aggregata, Eugenia involucrata, Euterpe edulis, Spondia mombin, Syzygium jambos e Terminalia catappa. Esse estudo demonstra a necessidade de levantamentos abrangentes sobre a diversidade de espécies fungos em plantas nativas e alerta sobre o risco de transmissão para as plantas de interesse econômico.