Campo DC | Valor | Idioma |
dc.contributor.advisor | Araújo, Carla Nunes de | - |
dc.contributor.author | Silva, Gabriel dos Santos | - |
dc.date.accessioned | 2024-07-12T01:16:06Z | - |
dc.date.available | 2024-07-12T01:16:06Z | - |
dc.date.issued | 2024-07-11 | - |
dc.date.submitted | 2023-10-06 | - |
dc.identifier.citation | SILVA, Gabriel dos Santos. Integração de estratégias computacionais e experimentais para a investigação da proteína ligante de odor (OBP) salivar de Rhodnius Neglectus, vetor da Doença de Chagas. 2023. 100 f., il. Dissertação (Mestrado em Ciências Médicas) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/48780 | - |
dc.description | Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas, 2023. | pt_BR |
dc.description.abstract | O Rhodnius neglectus, um inseto da família Reduviidae (Hemiptera), é um potencial
vetor do Trypanosoma cruzi, o protozoário responsável pela doença de Chagas. Na
saliva do R. neglectus, encontram-se moléculas importantes que neutralizam os
mecanismos de coagulação do hospedeiro, auxiliando na alimentação sanguínea e,
indiretamente, na transmissão do protozoário. Por isso, a saliva desse inseto
hematófago tem sido alvo relevante de estudos devido à presença de moléculas com
alto potencial biotecnológico. Este trabalho teve como objetivo estudar uma Proteína
de Ligação a Odorantes da saliva do R. neglectus (RnOBP) visando contribuir na
compreensão de suas características estruturais e funcionais, utilizando abordagens
computacionais e experimentais. Foram realizadas modelagens moleculares da
RnOBP e ensaios computacionais de dinâmica molecular e clusterização para obter
informações sobre a flexibilidade da proteína. Em seguida, foram realizados ensaios
de docking molecular para verificar a afinidade da RnOBP com alguns ligantes
relacionados à coagulação de vertebrados. Por fim, observou-se uma possível forma
de oligomerização da RnOBP. Para a obtenção da RnOBP recombinante, a sequência
nucleotídica da proteína foi obtida a partir do transcriptoma do R. neglectus, clonada
no vetor de expressão pET100/D-TOPO e produzida por bactérias Escherichia coli
Rosetta(DE3)pLysS. A RnOBP recombinante foi purificada por cromatografia de
afinidade, renovelada e utilizada em ensaios de caracterização biofísica. O modelo
gerado pelo Alphafold mostrou que a RnOBP é formada por hélices α e possui uma
cavidade interna significativa, potencialmente um sítio de ligação. Em comparação
com outras OBPs de insetos, independentemente da composição ou classificação da
OBP, a região do sítio de ligação é bem conservada. A RnOBP recombinante
purificada a partir de corpos de inclusão revelou uma composição de estrutura
secundária diferente da esperada. Os ensaios funcionais iniciais mostraram que a
rRnOBP pode atuar na inibição da agregação plaquetária, mas não a coagulação.
Este estudo mostrou propriedades estruturais da RnOBP e pode contribuir para a
compreensão de suas funções e potencial biotecnológico. | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Integração de estratégias computacionais e experimentais para a investigação da proteína ligante de odor (OBP) salivar de Rhodnius Neglectus, vetor da Doença de Chagas | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.subject.keyword | Odorant binding protein | pt_BR |
dc.subject.keyword | Rhodnius neglectus | pt_BR |
dc.subject.keyword | Chagas, Doença de | pt_BR |
dc.contributor.advisorco | Mottin, Melina | - |
dc.description.abstract1 | Rhodnius neglectus, an insect from the Reduviidae family (Hemiptera), is a potential
vector of Trypanosoma cruzi, the causative protozoan of Chagas disease. Triatomine
saliva comprises a rich mixture of molecules synthesized by the salivary glands to
counter host responses, aid the uptake of blood and, indirectly, T. cruzi transmission.
Therefore, the saliva of this hematophagous insect has been a relevant subject of
studies due to the presence of these molecules with high biotechnological potential.
The goal of this work was to study an Odorant Binding Protein from R. neglectus saliva
(RnOBP) using computational and experimental approaches aiming, to contribute to
the understanding of its structural and functional characteristics. RnOBP molecular
modeling, computational molecular dynamics and clustering tests were performed to
obtain information about the protein's flexibility. Next, molecular docking assays were
carried out to verify the affinity of RnOBP with agonists of vertebrate coagulation
pathways. Finally, putative RnOBP oligomers were observed. To obtain the
recombinant RnOBP, its nucleotide sequence was obtained from the R. neglectus
transcriptome, cloned into the pET100/D-TOPO expression vector and produced by
Escherichia coli Rosetta(DE3)pLysS bacteria. The recombinant RnOBP was purified
by affinity chromatography, refolded, and used in biophysical characterization assays.
This protein is modeled to be entirely formed by α-helices and have a significant
internal cavity, potentially a ligand-binding site. Compared with insect OBPs,
regardless of the composition or classification of the OBP, the binding site region is
well conserved. The recombinant RnOBP purified from inclusion bodies revealed a
secondary structure composition different than expected. Initial functional indicated
rRnOBP could act to inhibit platelet aggregation, but not coagulation. This study
showed RnOBP structural properties and may contribute to the understanding of its
functions and biotechnological potential. | pt_BR |
dc.description.unidade | Faculdade de Medicina (FMD) | pt_BR |
dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Ciências Médicas | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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