Título :	A distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation
Autor :	Ribeiro, Edward de Oliveira Zerlotini, Gustavo G. Lopes, Irving R. M. Ribeiro, Victor B. R. Melo, Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de Walter, Maria Emília Machado Telles Costa, Marcos Mota BIOFOCO Network
Assunto::	Processamento eletrônico de dados - processamento distribuído Interpro Biologia computacional
Fecha de publicación :	30-sep-2005
Editorial :	FUNPEC-RP
Citación :	RIBEIRO, Edward et al. A distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation. Genetics and Molecular Research, v. 4, n. 3, p. 590-598, 2005. Disponível em: <http://www.funpecrp.com.br/gmr/year2005/vol3-4/pdf/wob10.pdf>. Acesso em: 15 jun. 2018.
Abstract:	Interpro is a widely used tool for protein annotation in genome sequencing projects, demanding a large amount of computation and representing a huge time-consuming step. We present a strategy to execute programs using databases Pfam, PROSITE and ProDom of Interpro in a distributed environment using a Java-based messaging system. We developed a two-layer scheduling architecture of the distributed infrastructure. Then, we made experiments and analyzed the results. Our distributed system gave much better results than Interpro Pfam, PROSITE and ProDom running in a centralized platform. This approach seems to be appropriate and promising for highly demanding computational tools used for biological applications.
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