DC Field | Value | Language |
dc.contributor.advisor | Gonçalves, Rodrigo Gurgel | - |
dc.contributor.author | Sá, Lana Cristina Evangelista Ferreira | - |
dc.date.accessioned | 2024-07-24T15:34:53Z | - |
dc.date.available | 2024-07-24T15:34:53Z | - |
dc.date.issued | 2024-07-24 | - |
dc.date.submitted | 2023-02-16 | - |
dc.identifier.citation | SÁ, Lana Cristina Evangelista Ferreira. Detecção de Giardia duodenalis: separando os efeitos da eliminação irregular de parasitos nas fezes e a sensibilidade imperfeita do exame microscópico. 2023. 136 f., il. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical) — Universidade de Brasília, Brasília, 2023. | pt_BR |
dc.identifier.uri | http://repositorio2.unb.br/jspui/handle/10482/49161 | - |
dc.description | Dissertação (mestrado) — Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical, 2023. | pt_BR |
dc.description.abstract | Giardia duodenalis é uma das principais causas globais de diarreia. O diagnóstico
geralmente envolve a detecção, usando microscopia óptica, de parasitos nas fezes.
Contudo, nem todas as amostras de fezes de pessoas infectadas contêm parasitos
(porque a eliminação de parasitos é irregular), e nem todos os testes detectam os
parasitos presentes em amostras positivas (porque a sensibilidade dos testes é
imperfeita). Isto dificulta a compreensão das dinâmicas de transmissão e a avaliação
do desempenho dos testes diagnósticos. Neste trabalho, ilustramos uma abordagem
desenhada para estimar separadamente as probabilidades de eliminação de parasitos
nas fezes (θ) e de detecção de parasitos em amostras positivas (𝑝); esta informação
permite derivar estimativas corrigidas da frequência de infecção (Ψ). Coletamos 1−3
amostras de fezes, em semanas consecutivas, de 276 crianças (4−76 meses) de oito
creches em quatro setores do Distrito Federal, Brasil. As amostras foram processadas
por sedimentação espontânea e analisadas por dois observadores independentes (um
experiente, um inexperiente). Usando estes resultados replicados e modelos
hierárquicos multi-nível, estimamos θ (θ̂ = 0.44 [IC95%0.24 − 0.66]); 𝑝
(𝑝̂Experiente = 0.64 [0.47 − 0.78]; 𝑝̂Inexperiente = 0.46 [0.33 − 0.66]); e Ψ
(Ψ̂Meninas = 0.54 [0.28 − 0.77]; Ψ̂Μeninos = 0.34 [0.17 − 0.54]). Não encontramos
evidência de que θ mudasse com o gênero ou a idade das crianças, ou entre dias de
coleta; 𝑝 mudasse com a idade; ou Ψ mudasse com a idade ou entre setores urbanos.
A probabilidade média de um observador experiente, usando um teste, detectar
Giardia em uma amostra procedente de uma criança infectada foi
Pr(𝑑|+, Experiente) = Ψ × θ̂ × 𝑝̂Experiente = 1.0 × 0.44 × 0.64 ≈ 0.28. O valor máximo de Pr(𝑑|+), caso existisse um Teste Perfeito, seria Pr(𝑑|+, TP) = Ψ × θ̂ × 𝑝TP = 1.0 × θ̂ × 1.0 ≈ 0.44; portanto, para alcançar Pr(𝑑|+) > 0.44 é necessário aumentar θ usando amostras replicadas. Nossas análises sugerem que ~56% das amostras de fezes de crianças infectadas não continha cistos de Giardia. Como nenhum teste pode (ou deveria) detectar parasitos em amostras sem parasitos, ̂ ≈ 0.44 sinaliza o limite máximo da probabilidade de detectar Giardia em uma amostra procedente de um indivíduo infectado. A única estratégia capaz de levar Pr(𝑑|+) para além desse limite é usar amostras replicadas; com quatro amostras, θ̂
4a ≈ 1 − (1 − 0.44) 4 ≈ 0.90, e Pr(𝑑| + ,4a, Experiente) = Ψ × θ̂ 4a × 𝑝̂Experiente = 1.0 × 0.90 × 0.64 ≈ 0.58. A abordagem que descrevemos abre novas perspectivas para o estudo tanto dos ciclos de transmissão quanto dos procedimentos diagnósticos das parasitoses intestinais. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). | pt_BR |
dc.language.iso | por | pt_BR |
dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
dc.title | Detecção de Giardia duodenalis : separando os efeitos da eliminação irregular de parasitos nas fezes e a sensibilidade imperfeita do exame microscópico | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.subject.keyword | Creches | pt_BR |
dc.subject.keyword | Crianças | pt_BR |
dc.subject.keyword | Distrito Federal (DF) | pt_BR |
dc.subject.keyword | Exames laboratoriais | pt_BR |
dc.subject.keyword | Parasito | pt_BR |
dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade de Brasília e o IBICT a disponibilizar por meio dos sites www.unb.br, www.ibict.br, www.ndltd.org sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra supracitada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, a partir desta data. | pt_BR |
dc.contributor.advisorco | Machado, Eleuza Rodrigues | - |
dc.description.abstract1 | The parasitic protozoan Giardia duodenalis (‘Giardia’ hereafter) is a leading global
cause of diarrhea. As with many other intestinal pathogens, Giardia diagnosis typically
involves detecting parasite presence in stool samples. However, not all stool samples
drawn from infected individuals contain parasites (due to irregular parasite shedding),
and no test can detect the target parasites in 100% of the samples that indeed contain
those parasites (due to imperfect test sensitivity). Disentangling the effects of irregular
shedding and imperfect sensitivity on parasite detection would help us better
understand both transmission dynamics (which heavily depend on parasite-shedding
probabilities) and diagnostic-test performance (of which sensitivity is a critical
component). Here, we illustrate an approach to separately estimating, under the
assumption of no false-positives, the probabilities of Giardia shedding in the stool of
infected hosts (denoted θ) and of Giardia detection in Giardia-positive stool samples
(true test sensitivity, denoted p). With this information, we then derive corrected
estimates of host-infection frequency (Ψ). We collected 1–3 stool samples, in
consecutive weeks, from 276 children (4–73 months) attending 8 kindergartens in 4
urban sectors of the Federal District, Brazil. Samples were processed by the
spontaneous-sedimentation method and examined via optical microscopy by two
independent observers – an expert parasitologist and a graduate student. Using these
replicate test results and multi-level hierarchical models, we estimated (i) the
probability of Giardia shedding: θ̂ = 0.44 [CI95%0.24 − 0.66]; (ii) observer-specific
test sensitivities: 𝑝̂Expert = 0.64 [0.47 − 0.78]; 𝑝̂Non−expert = 0.46 [0.33 − 0.66];
and (iii) gender-specific infection frequencies: Ψ̂Girls = 0.54 [0.28 − 0.77]; Ψ̂Boys =
0.34 [0.17 − 0.54]. We found no evidence that shedding changed with child gender
or age, or between stool sample-collection days; that test sensitivity depended on child
age; or that infection frequency changed with child age or varied among urban sectors.
The average probability that an expert observer, using a single test, detects Giardia in
a stool sample drawn from an infected child was estimated at Pr(𝑑|+) = Ψ × θ̂ × 𝑝̂Expert = 1.0 × 0.44 × 0.64 ≈ 0.28 (or 28%). The maximum value Pr(𝑑|+) could attain, if a Perfect Test (𝑝PT = 1.0) existed (it does not), would be Pr(𝑑|+, PT) = Ψ × θ̂ × 𝑝̂PT = 1.0 × 0.44 × 1.0 ≈ 0.44 (or 44%). Therefore, reaching Pr(𝑑|+) > 0.44 requires increasing θ, which in turn requires drawing, then pooling, replicate stool samples. Our analyses suggest, in sum, that ~56% of stool samples drawn from infected children did not contain Giardia cysts. As no specific test can (or should) detect parasites in parasite-free samples, θ̂ ≈ 0.44 measures the
upper limit of the probability of detecting Giardia in a single stool sample drawn from
an infected child. The only strategy capable of taking Pr(d|+) beyond this limit is to
draw-and-pool replicate samples; with 4 pooled samples, for example, θ̂ 4s ≈ 1 −
(1 − 0.44) 4 ≈ 0.90, and Pr(𝑑|+) = Ψ × θ̂ 4s × 𝑝̂Expert = 1.0 × 0.90 × 0.64 ≈ 0.58
(or 58%). By allowing estimation (and modeling) of pathogen-shedding probabilities
(θ), the approach we illustrate paves the way to studying pathogen transmission cycles
and dynamics in unprecedented detail. Separate estimation (and modeling) of true test
sensitivity (p), moreover, may cast new light on the performance of many highlyspecific microscopy-based diagnostics used in routine practice to detect pathogens in
biological samples. | pt_BR |
dc.description.unidade | Faculdade de Medicina (FMD) | pt_BR |
dc.description.ppg | Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical | pt_BR |
Appears in Collections: | Teses, dissertações e produtos pós-doutorado
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