Estrutura populacional e diversidade genética de reprodutores de truta-arco-íris (Oncorhynchus mykiss) no Brasil usando marcadores SNPs

Abstract

Este estudo teve como objetivo avaliar a estrutura e diversidade genética dentro e entre planteis comerciais de reprodutores de truta-arco-íris (Oncorhynchus mykiss) em truticulturas nacionais com um painel de marcadores SNP de baixa densidade. A truta-arco-íris é nativa da costa do Oceano Pacífico na América do Norte e da Península Kamchatka da Rússia e foi introduzida no Brasil a partir da década de 1950, tendo a produção concentra nas regiões de altitude elevada e clima frio. Apesar da produção ser regionalizada, ela possui abrangência moderada no mercado nacional. Pesquisas com abordagens genômicas e moleculares têm sido utilizadas para auxiliar na resolução de problemas de sanidade e desenvolver ferramentas que possibilitem a redução de perdas e incremento da produção de truta-arco-íris pelo mundo. No Brasil as pesquisas com truta-arco-íris foram voltadas para aspectos ecológicos e históricos da introdução da espécie no país, viabilidade econômica do sistema produtivo, aspectos reprodutivos, sanitários e manejo. Existem poucas informações sobre a composição e estrutura genética dos plantéis comerciais de reprodutores de trutas do Brasil. Estudos de populações selvagens e linhagens comerciais de truta, com ferramentas genômicas contemporâneas, baseadas em marcadores moleculares SNP (do inglês Single Nucleotide Polymophisms), podem ser observados em outros países, mas não no Brasil. Painéis SNP de baixa densidade reduzem o custo de genotipagem por amostra e podem ser aplicados para análise de parentesco, estimativas de diversidade e até seleção genômica. Utilizamos um painel de 95 marcadores SNPs para analisar a estutura populacional e diversidade genética de sete plantéis comerciais de truta-arcoíris das regiões Sul e Sudeste do Brasil. A média das heterozigosidades observadas e esperadas foram de 0,409 e 0,391, respectivamente. O Fst total foi de 0,177 e os valores Fst pareados considerando todas as linhagens variaram de 0.036 a 0.338. O painel de SNPs apresentou desempenho satisfatório em estimar coeficiente de parentesco e organizar os reprodutores quanto ao nível de parentesco e origem populacional. Os grupos de reprodutores analisados apresentaram baixa taxa de endogamia acumulada (Fis de -0.192 a 0.039), sugerindo que os os métodos de manejo genético dos plantéis têm sido satisfatórios, mantendo a variabilidade genética existente nas importações realizadas. Desse modo, a utilização de um Painel de SNPs é uma estratégia promissora para analisar a diversidade e diferenciação dos planteis comerciais de trutas produzidas no Brasil, bem como para apoiar esforços para o incremento da cadeia produtiva da espécie nas regiões do país com potencial produtivo.