http://repositorio.unb.br/handle/10482/39957| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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| ARTIGO_ComputationalBasesStudy.pdf | 290,61 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
| Título: | Computational bases study for complexes containing Cd (II) and biological evaluation in silico |
| Outros títulos: | Estudo de bases computacionais para complexos contendo Cd (II) e avaliação biológica in silico Estudio de bases computacionales para complejos que contienen Cd (II) y evaluación biológica in silico |
| Autor(es): | Bastos, Ruan Sousa Araújo, Joabe Lima Ferreira, Maria de Lourde de Aguiar Silva Silva, Welson de Freitas Passos, Ionara Nayana Gomes Lima, Francisco das Chagas Alves Rocha, Jefferson Almeida |
| ORCID: | https://orcid.org/0000-0003-3585-1596 https://orcid.org/0000-0002-4806-9192 https://orcid.org/0000-0002-1964-7926 https://orcid.org/0000-0001-6682-3358 https://orcid.org/0000-0003-4729-4977 https://orcid.org/0000-0002-0447-4911 https://orcid.org/0000-0001-6619-2293 |
| Assunto: | Cádmio Conjunto de bases computacionais |
| Data de publicação: | 23-Jan-2021 |
| Editora: | CDRR Editors |
| Referência: | BASTOS, Ruan Sousa et al. Computational bases study for complexes containing Cd (II) and biological evaluation in silico. Research, Society and Development, v. 10, n. 1, e45110111966, 2021. DOI: http://dx.doi.org/10.33448/rsd-v10i1.11966. Disponível em: https://rsdjournal.org/index.php/rsd/article/view/11966. Acesso em: 25 jan. 2021. |
| Resumo: | A química computacional só ganhou reconhecimento internacional depois de contribuir significativamente para os avanços científicos que resultaram em prêmios Nobel. Com a evolução tecnológica das últimas décadas softwares foram criados com o objetivo de estudar, investigar e compreender os processos químicos a nível molecular de estudos experimentais. Isso promoveu agilidade nas pesquisas e reduziu custos com trabalhos laboratoriais. Neste trabalho foram estudados 5 diferentes conjuntos de bases computacionais: STO-3G, LAN2DZ, SDD, 3-21G e DGDZVP, utilizando o software GaussView 5 e Gaussian 09w com o método DFT e B3LYP híbrido funcional. Foram obtidos os parâmetros de distância e ângulo do complexo di-u-cloro-bis [cloro (4,7-dimetil-1,10-fenantrolina) cádmio (II)]. Observou-se os valores de RMSD obtidos para cada uma das bases. Teste de docking molecular foi realizado para cada base, para verificar qual apresentava melhores parâmetros. Notou-se neste estudo que o conjunto de bases SDD apresentou os melhores resultados nos testes, sendo classificado como o mais adequado para estudos de estruturas contendo o elemento cádmio em sua composição. |
| Abstract: | Computational chemistry only gained international recognition after making a significant contribution to the scientific advances that resulted in Nobel prizes. With the technological evolution of the last decades, software was created with the aim of studying, investigating and understanding chemical processes at the molecular level of experimental studies. This promoted research agility and reduced costs with laboratory work. In this work, 5 different sets of computational bases were studied: STO-3G, LAN2DZ, SDD, 3-21G and DGDZVP, using the GaussView 5 and Gaussian 09w software with the DFT and B3LYP functional hybrid method. The distance and angle parameters of the di-u-chloro-bis complex [chlorine (4,7-dimethyl-1,10-phenanthroline) cadmium (II)] were obtained. The RMSD values obtained for each of the bases were observed. Molecular docking test was performed for each base, to verify which one had better parameters. It was noted in this study that the set of SDD bases presented the best results in the tests, being classified as the most suitable for studies of structures containing the element cadmium in its composition. |
| Resumen: | La química computacional solo ganó reconocimiento internacional después de hacer una contribución significativa a los avances científicos que resultaron en premios Nobel. Con la evolución tecnológica de las últimas décadas, se creó un software con el objetivo de estudiar, investigar y comprender procesos químicos a nivel molecular de estudios experimentales. Esto promovió la agilidad de la investigación y redujo los costos con el trabajo de laboratorio. En este trabajo se estudiaron 5 conjuntos diferentes de bases computacionales: STO-3G, LAN2DZ, SDD, 3-21G y DGDZVP, utilizando el software GaussView 5 y Gaussian 09w con el método híbrido funcional DFT y B3LYP. Se obtuvieron los parámetros de distancia y ángulo del complejo di-u-cloro-bis [cloro (4,7-dimetil-1,10-fenantrolina) cadmio (II)]. Se observaron los valores de RMSD obtenidos para cada una de las bases. Se realizó prueba de acoplamiento molecular para cada base, para verificar cuál tenía mejores parámetros. En este estudio se observó que el conjunto de bases SDD presentó los mejores resultados en las pruebas, siendo clasificado como el más adecuado para estudios de estructuras que contienen el elemento cadmio en su composición. |
| Licença: | (CC BY 4.0) |
| DOI: | http://dx.doi.org/10.33448/rsd-v10i1.11966 |
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