Estudos genômicos, filogenéticos e proteômicos de alfavírus (CHIKV e MAYV)

Abstract

Os arbovírus são vírus que necessitam de um vetor artrópode para serem transmitidos. Entre eles, estão o Chikungunya virus (CHIKV) e o Mayaro virus (MAYV), dois integrantes do gênero Alphavirus, família Togaviridae. Ambos são arbovírus artritogênicos que apresentam genoma de RNA fita simples senso positivo de aproximados 12kb. O CHIKV é amplamente distribuído e, apesar de já ter causado graves epidemias no Brasil, há poucos isolados brasileiros com genoma completo sequenciado. Por outro lado, o MAYV possui distribuição quase restrita à América do Sul, sendo um vírus historicamente negligenciado. Apesar de ser transmitido principalmente por Haemagogus spp., o MAYV também pode ser transmitido por mosquitos de outros gêneros, como o Aedes aegypti. Assim, no Capítulo 2 do presente trabalho, foram realizados o sequenciamento de alto desempenho do genoma completo e um estudo de filogenia de seis isolados de CHIKV do Centro-Oeste brasileiro. Esses isolados, os primeiros a serem publicados de tal região, apresentaram sequências de 11.811 nucleotídeos. Nenhum deles possui as mutações A226V (E1) ou L210Q (E2), presentes em isolados transmitidos por Aedes albopictus, sendo provavelmente transmitidos pelo vetor urbano principal A. aegypti. A análise filogenética mostrou que os isolados de CHIKV do Centro-Oeste pertencem à linhagem East-Central-South Africa. Já o Capítulo 3 focou na análise proteômica qualitativa de cultura de células Aag-2 de A. aegypti durante infecção por MAYV, visto que as proteínas são as principais mediadoras da comunicação intracelular. Após espectrometria de massas, foram identificadas 191 proteínas estatisticamente significativas. Ao longo das 48h de infecção, as proteínas da célula hospedeira, em geral, tiveram sua abundância reduzida. Já as proteínas virais foram super expressas. As proteínas de A. aegypti que foram super expressas mostraram-se importantes para a replicação viral, como a proibitina, a enolase fosfatase e1, chaperonas, uma sinaptobrevina e o fator de transcrição HCFC1. Tais proteínas já foram também identificadas como super expressas em estudos envolvendo outros arbovírus. Além do mais, vias de secreção clássicas de proteínas foram menos utilizadas durante a infecção, enquanto vias não convencionais foram ativadas. Juntos, esses dados auxiliam na compreensão da evolução e da dispersão de CHIKV, assim como elucidam componentes que são essenciais para a infecção por MAYV, sendo possivelmente importantes para a relação arbovírus-vetor em geral.