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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 15-Mai-2016 | 9-Set-2015 | Algoritmos paralelos exatos e otimizações para alinhamento de sequências biológicas longas em plataformas de alto desempenho | Sandes, Edans Flávius de Oliveira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| Mai-2008 | Mai-2008 | Arquiteturas em FPGA para comparação de sequências biológicas em espaço linear | Corrêa, Jan Mendonça | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 2005 | - | Bioinformatics of the Paracoccidioides brasiliensis EST Project | Brígido, Marcelo de Macedo; Walter, Maria Emília Machado Telles; Oliveira, Adilton G.; Inoue, Marcus K.; Anjos, Daniel dos Santos; Sandes, Edans Flávius de Oliveira; Gondim, João José da Costa; Carvalho, Maria José de Albuquerque; Almeida Júnior, Nalvo Franco de; Felipe, Maria Sueli Soares | - | - |
| 27-Fev-2012 | 30-Jun-2011 | Comparação paralela de sequências biológicas longas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPUs) | Sandes, Edans Flávius de Oliveira | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 26-Abr-2013 | 31-Jan-2013 | Comparação paralela exata de sequências biológicas em plataformas híbridas de alto desempenho | Mendonça, Fernando Machado | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 16-Nov-2009 | 20-Mar-2006 | Comparação paralela exata de seqüências biológicas longas com uso limitado de memória | Batista, Rodolfo Bezerra | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| 30-Set-2005 | - | A distributed computation of Interpro Pfam, PROSITE and ProDom for protein annotation | Ribeiro, Edward de Oliveira; Zerlotini, Gustavo G.; Lopes, Irving R. M.; Ribeiro, Victor B. R.; Melo, Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de; Walter, Maria Emília Machado Telles; Costa, Marcos Mota; BIOFOCO Network | - | - |
| 15-Abr-2011 | 23-Set-2010 | Escalonamento de tarefas no ambiente do Peer-to-peer do BIOFOCO III | Tedesque, José Carlos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 19-Jan-2011 | 25-Out-2010 | Estratégia distribuída híbrida em cluster multicore heterogêneo para alinhamento múltiplo de sequencias biológicas com o dialign-tx | Macedo, Emerson de Araújo | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | Pfischer, Gerson Henrique |
| 20-Mai-2013 | 28-Ago-2012 | Estratégia paralela exata para o alinhamento múlltiplo de sequências biológicas utilizando Unidades de Processamento Gráfico (GPU) | Lima, Daniel Sundfeld | Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de | - |
| Mai-2015 | - | Evaluating the Cassandra NoSQL Database Approach for Genomic Data Persistency | Aniceto, Rodrigo; Xavier, Rene; Guimarães, Valeria; Hondo, Fernanda; Holanda, Maristela; Walter, Maria Emília Machado Telles; Lifschitz, Sérgio | - | - |
| 2012 | - | Exact parallel alignment of megabase genomic sequences with tunable work distribution | Boukerche, Azzedine; Batista, Rodolfo Bezerra; Melo, Alba Cristina Magalhães Alves de; Scarel, Felipe Brandt; Souza, Lavir Antonio Bahia Carvalho de | - | - |
| 22-Jun-2012 | 9-Mar-2012 | Identificação de RNA não codificador utilizando redes neurais artificiais de treinamento não supervisionado | Silva, Tulio Conrado Campos da | Berger, Pedro de Azevedo | - |
| 2013 | - | A method to find groups of orthogous genes across multiple genomes | Telles, Guilherme P.; Almeida Júnior, Nalvo Franco de; Alvarez, Paulo A.; Brígido, Marcelo de Macedo; Walter, Maria Emília Machado Telles | - | - |
| 22-Fev-2017 | 3-Mar-2016 | Método in silico para análise de sequências de imunoglobulinas produzidas por tecnologia de phage display | Silva, Heide Muniz | Brígido, Marcelo de Macedo | Almeida Júnior, Nalvo Franco |
| 30-Jul-2012 | 1-Mar-2012 | Modelo de dados para um Pipeline de seqüenciamento de alto desempenho transcritômico | Huacarpuma, Ruben Cruz | Holanda, Maristela Terto de | - |
| 14-Dez-2006 | 14-Dez-2006 | Ordenação por transposições baseado no formalismo algébrico | Santos, Héderson Pereira dos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 11-Jan-2010 | 27-Mar-2006 | p2pBIOFOCO : um framework Peer-to-Peer para processamento distribuido do BLAST | Ribeiro, Edward de Oliveira | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 4-Mar-2017 | - | PlantRNA_sniffer : a SVM-based workflow to predict long intergenic non-coding RNAs in plants | Vieira, Lucas Maciel; Grativol, Clicia; Thiebaut, Flavia; Carvalho, Thais G.; Hardoim, Pablo R.; Hemerly, Adriana; Lifschitz, Sergio; Ferreira, Paulo Cavalcanti Gomes; Walter, Maria Emília Machado Telles | - | - |
| Nov-2013 | - | Provenance in bioinformatics workflows | Paula, Renato de; Holanda, Maristela; Gomes, Luciana S. A.; Lifschitz, Sergio; Walter, Maria Emília Machado Telles | - | - |
