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| Data de publicação | Data de defesa | Título | Autor(es) | Orientador(es) | Coorientador(es) |
| 27-Nov-2018 | 10-Abr-2018 | Algoritmos genéticos para filogenia viva com matriz de características | Fernandes, Rafael Lins | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 7-Fev-2013 | 22-Jun-2012 | BioNimbus : uma arquitetura de federação de nuvens computacionais híbrida para a execução de workflows de Bioinformática | Saldanha, Hugo Vasconcelos | Walter, Maria Emília Machado Telles | Araújo, Aletéia Patrícia F. |
| 20-Fev-2018 | 28-Set-2017 | Distinguishing long non-coding RNAs from protein coding transcripts based on machine learning techniques | Schneider, Hugo Wruck | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 15-Abr-2011 | 23-Set-2010 | Escalonamento de tarefas no ambiente do Peer-to-peer do BIOFOCO III | Tedesque, José Carlos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 13-Ago-2024 | 28-Fev-2023 | Exploring relevant features of colorectal cancer from clinical and biological data : a bioinformatics approach | Vieira, Lucas Maciel | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 27-Fev-2013 | 8-Jun-2010 | Ferramenta de visualização interativa de comparação entre múltiplos genomas para a identificação de Sintenias | Coimbra, Rodrigo Carneiro Munhoz | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 20-Dez-2012 | 24-Ago-2012 | Identificação de RNAs não-codificadores por modelos de covariância com prioris Dirichlet adaptadas a grupos de ncRNAs com estruturas secundárias similares = Identifying non-coding RNAs using covariance models with Dirichlet priors specific to groups of ncRNAs of similar secondary structures | Lessa, Felipe Almeida | Walter, Maria Emília Machado Telles | Martins Neto, Daniele da Silva Baratela |
| 6-Dez-2016 | 29-Jan-2016 | Identificação de snoRNAs usando aprendizagem de máquina | Oliveira, João Victor de Araujo | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 3-Mai-2021 | 18-Dez-2020 | Investigando o desempenho de métodos de Aprendizado de Máquina para predição de RNAs não-codificadores utilizando construção in silico de dados artificiais | Costa, Mirele Carolina Souza Ferreira | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 12-Abr-2018 | 12-Dez-2017 | Método baseado em aprendizado de máquina para seleção de características para distinção entre RNAs não-codificadores longos e RNAs codificadores de proteínas | Kümmel, Bruno Couto | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 2-Dez-2014 | 25-Jul-2014 | Método para reconstrução in silico de redes metabólicas de fungos : um estudo de caso para o Paracoccidioides lutzii | Silva, Waldeyr Mendes Cordeiro da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 22-Ago-2018 | 1-Mar-2018 | Métodos baseados em aprendizagem de máquina para distinguir RNAs longos não-codificadores intergênicos de transcritos codificadores de proteínas | Vieira, Lucas Maciel | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 17-Dez-2015 | 10-Jul-2015 | ncRNA-Agents : anotação de RNAs não-codificadores baseada em sistema multiagente | Arruda, Wosley da Costa | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 9-Set-2022 | 31-Mai-2022 | Um novo algoritmo 1.375-aproximativo baseado em grupos de permutações para o Problema da Ordenação por Transposições | Silva, Luiz Augusto Garcia da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 14-Dez-2006 | 14-Dez-2006 | Ordenação por transposições baseado no formalismo algébrico | Santos, Héderson Pereira dos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 29-Mar-2016 | 24-Jun-2015 | Otimização multiobjetivo aplicada ao planejamento sistemático de conservação para espécies de plantas do cerrado brasileiro | Santos, Shana Schlottfeldt | Walter, Maria Emília Machado Telles | Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de |
| 11-Jan-2010 | 27-Mar-2006 | p2pBIOFOCO : um framework Peer-to-Peer para processamento distribuido do BLAST | Ribeiro, Edward de Oliveira | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 6-Ago-2013 | 22-Fev-2012 | Reconstrução in silico da rede metabólica do fungo Paracoccidioides lutzii | Alvarez, Paulo Antonio | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 16-Abr-2014 | 1-Dez-2013 | Um algoritmo algébrico para o Problema da Distância de Transposição em Rearranjo de Genomas | Silva, Luiz Augusto Garcia da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 20-Mai-2015 | 15-Dez-2014 | Uma ferramenta multiagente baseada em conhecimento para anotação de proteínas : um estudo de caso para o Fungo Saccharomyces cerevisiae | Souza, Daniel da Silva | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
