| Date de publication | Data de defesa | Titre | Auteur(s) | Orientador(es) | Coorientador(es): |
| 27-nov-2018 | 10-avr-2018 | Algoritmos genéticos para filogenia viva com matriz de características | Fernandes, Rafael Lins | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 7-fév-2013 | 22-jui-2012 | BioNimbus : uma arquitetura de federação de nuvens computacionais híbrida para a execução de workflows de Bioinformática | Saldanha, Hugo Vasconcelos | Walter, Maria Emília Machado Telles | Araújo, Aletéia Patrícia F. |
| 20-fév-2018 | 28-sep-2017 | Distinguishing long non-coding RNAs from protein coding transcripts based on machine learning techniques | Schneider, Hugo Wruck | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 15-avr-2011 | 23-sep-2010 | Escalonamento de tarefas no ambiente do Peer-to-peer do BIOFOCO III | Tedesque, José Carlos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 27-fév-2013 | 8-jui-2010 | Ferramenta de visualização interativa de comparação entre múltiplos genomas para a identificação de Sintenias | Coimbra, Rodrigo Carneiro Munhoz | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 20-déc-2012 | 24-aoû-2012 | Identificação de RNAs não-codificadores por modelos de covariância com prioris Dirichlet adaptadas a grupos de ncRNAs com estruturas secundárias similares = Identifying non-coding RNAs using covariance models with Dirichlet priors specific to groups of ncRNAs of similar secondary structures | Lessa, Felipe Almeida | Walter, Maria Emília Machado Telles | Martins Neto, Daniele da Silva Baratela |
| 6-déc-2016 | 29-jan-2016 | Identificação de snoRNAs usando aprendizagem de máquina | Oliveira, João Victor de Araujo | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 3-mai-2021 | 18-déc-2020 | Investigando o desempenho de métodos de Aprendizado de Máquina para predição de RNAs não-codificadores utilizando construção in silico de dados artificiais | Costa, Mirele Carolina Souza Ferreira | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 12-avr-2018 | 12-déc-2017 | Método baseado em aprendizado de máquina para seleção de características para distinção entre RNAs não-codificadores longos e RNAs codificadores de proteínas | Kümmel, Bruno Couto | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 2-déc-2014 | 25-jui-2014 | Método para reconstrução in silico de redes metabólicas de fungos : um estudo de caso para o Paracoccidioides lutzii | Silva, Waldeyr Mendes Cordeiro da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 22-aoû-2018 | 1-mar-2018 | Métodos baseados em aprendizagem de máquina para distinguir RNAs longos não-codificadores intergênicos de transcritos codificadores de proteínas | Vieira, Lucas Maciel | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 17-déc-2015 | 10-jui-2015 | ncRNA-Agents : anotação de RNAs não-codificadores baseada em sistema multiagente | Arruda, Wosley da Costa | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 9-sep-2022 | 31-mai-2022 | Um novo algoritmo 1.375-aproximativo baseado em grupos de permutações para o Problema da Ordenação por Transposições | Silva, Luiz Augusto Garcia da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 14-déc-2006 | 14-déc-2006 | Ordenação por transposições baseado no formalismo algébrico | Santos, Héderson Pereira dos | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 29-mar-2016 | 24-jui-2015 | Otimização multiobjetivo aplicada ao planejamento sistemático de conservação para espécies de plantas do cerrado brasileiro | Santos, Shana Schlottfeldt | Walter, Maria Emília Machado Telles | Carvalho, André Carlos Ponce de Leon Ferreira de |
| 11-jan-2010 | 27-mar-2006 | p2pBIOFOCO : um framework Peer-to-Peer para processamento distribuido do BLAST | Ribeiro, Edward de Oliveira | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 6-aoû-2013 | 22-fév-2012 | Reconstrução in silico da rede metabólica do fungo Paracoccidioides lutzii | Alvarez, Paulo Antonio | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 16-avr-2014 | 1-déc-2013 | Um algoritmo algébrico para o Problema da Distância de Transposição em Rearranjo de Genomas | Silva, Luiz Augusto Garcia da | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 20-mai-2015 | 15-déc-2014 | Uma ferramenta multiagente baseada em conhecimento para anotação de proteínas : um estudo de caso para o Fungo Saccharomyces cerevisiae | Souza, Daniel da Silva | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
| 7-déc-2009 | 2006 | Visualização de dados genômicos do fungo Paracoccidioides brasiliensis | Ferreira, Marcos Francisco Ribeiro | Walter, Maria Emília Machado Telles | - |
